RESULTSCtIP expression is frequentl

RESULTS
CtIP expression is frequently down-regulated in breast cancers
CtIP association with BRCA1 facilitates HRR of DSBs by initiating DNA resection [14]. Cells defective in CtIP are highly sensitive to topoisomerase I/II poisons and ionizing radiation (IR) and are unable to repair Spo11-capped meiotic DSBs [15-20]. Therefore, we investigated the relationship of CtIP expression in breast cancers and their clinical outcome by using two publicly available microarray datasets in the Gene Expression Omnibus (GEO) database (GSE10780 [21] and GSE3744 [21]) that contain both normal and breast cancer samples. CtIP expression levels were measured as log2 (probe intensities) using Affymetrix microarrays. In both these two datasets, the levels of CtIP mRNA in breast cancers were statistically lower than those in normal breast tissues (Fig.1Aand Supplemental Fig.1A). Because patients diagnosed with triple negative breast cancer (TNBC) have a higher risk of disease relapse within 5 years than patients treated for other breast cancer subtypes [22], we compared the CtIP mRNA level in TNBC to that in non-TNBC by using one publicly available microarray dataset (GSE47561 [23]). We found that CtIP expression was significantly lower in triple negative breast cancer (Fig.1B), which is consistent with the previous study [24]. These results indicate that the expression level of CtIP is decreased in breast cancers. Furthermore, CtIP gene alterations were observed in several cancer types with either mutation, deletion or copy number variation (Supplemental Fig. 1C). However, the incidence of deletion or mutation of CtIPwas rather low in cancers. We thus speculated that CtIP down-regulation might be due to epigenetic or posttranscriptional regulation.

Результаты (русский) 1:

РЕЗУЛЬТАТЫCtIP выражение, часто вниз регулируется в опухоли молочной железыCtIP association with BRCA1 facilitates HRR of DSBs by initiating DNA resection [14]. Cells defective in CtIP are highly sensitive to topoisomerase I/II poisons and ionizing radiation (IR) and are unable to repair Spo11-capped meiotic DSBs [15-20]. Therefore, we investigated the relationship of CtIP expression in breast cancers and their clinical outcome by using two publicly available microarray datasets in the Gene Expression Omnibus (GEO) database (GSE10780 [21] and GSE3744 [21]) that contain both normal and breast cancer samples. CtIP expression levels were measured as log2 (probe intensities) using Affymetrix microarrays. In both these two datasets, the levels of CtIP mRNA in breast cancers were statistically lower than those in normal breast tissues (Fig.1Aand Supplemental Fig.1A). Because patients diagnosed with triple negative breast cancer (TNBC) have a higher risk of disease relapse within 5 years than patients treated for other breast cancer subtypes [22], we compared the CtIP mRNA level in TNBC to that in non-TNBC by using one publicly available microarray dataset (GSE47561 [23]). We found that CtIP expression was significantly lower in triple negative breast cancer (Fig.1B), which is consistent with the previous study [24]. These results indicate that the expression level of CtIP is decreased in breast cancers. Furthermore, CtIP gene alterations were observed in several cancer types with either mutation, deletion or copy number variation (Supplemental Fig. 1C). However, the incidence of deletion or mutation of CtIPwas rather low in cancers. We thus speculated that CtIP down-regulation might be due to epigenetic or posttranscriptional regulation.

Результаты (русский) 2:

РЕЗУЛЬТАТЫ
выражение CTIP часто подавляется в опухоли молочной железы
CTIP ассоциации с BRCA1 облегчает HRR ДР инициируя резекцию ДНК [14]. Клетки, дефектные по CTIP очень чувствительны к топоизомеразы I / II яды и ионизирующего излучения (ИК) и не в состоянии отремонтировать Spo11 вершины мейоза DSBs [15-20]. Таким образом, мы исследовали взаимосвязь экспрессии CTIP в молочной железы и их клинический исход с помощью двух публично доступных микрочипов наборов данных в экспрессии генов Омнибус (ГЭП) базы данных (GSE10780 [21] и GSE3744 [21]), которые содержат как нормальный и рак молочной железы Образцы. Уровни экспрессии CTIP измеряли, как log2 (интенсивности зонда) с помощью Affymetrix микрочипов. В обоих этих двух наборов данных, уровни мРНК в CTIP рака молочной железы были статистически ниже, чем в нормальной ткани молочной железы (Fig.1Aand Справочная рис.1а). Поскольку пациенты с диагнозом тройной негативным раком молочной железы (TNBC) имеют более высокий риск рецидива заболевания в течение 5 лет, чем у пациентов, получавших другие подтипы рака молочной железы [22], мы сравнили уровень CTIP мРНК в TNBC к, что в не-TNBC с помощью одного общедоступной микрочипов набор данных (GSE47561 [23]). Мы обнаружили, что выражение CTIP была значительно ниже в тройном негативным раком молочной железы (Fig.1b), что согласуется с предыдущим исследованием [24]. Эти результаты показывают, что уровень экспрессии CTIP уменьшается в опухоли молочной железы. Кроме того, CTIP генные изменения наблюдались в нескольких типов рака с любой мутации, делеции или числа копий вариации (Справочная рис. 1С). Тем не менее, заболеваемость удаление или мутации CtIPwas довольно низкой в рака. Таким образом, мы предположили, что CTIP вниз регулирование может быть связано с эпигенетической или посттранскрипционном регулирования.

Результаты (русский) 3:

результаты
ctip выражение часто вниз, регулируются в ассоциации с раком молочной железы,
ctip BRCA1 облегчает hrr из dsbs путем проведения днк - резекция [14].клетки дефектный в ctip очень чувствительны к топоизомераза I / II ядов и ионизирующего излучения (ик) и не в состоянии ремонта spo11 ограничено meiotic dsbs [15].таким образом,мы исследовали взаимосвязь ctip выражение в рак молочной железы и их клинические результаты с помощью двух гласности - микрочип наборов данных в экспрессии генов сводной (гэп) базы данных (gse10780 [21] и gse3744 [21]), которые содержат как обычных, так и рак молочной железы, образцы.ctip выражение уровнях были обнаружены в LOG2 (зонд света) с использованием affymetrix микрочипов.в обоих этих двух наборов данных, уровень ctip mrna в рака груди статистически ниже, чем в обычных тканей груди (fig.1aand дополнительных fig.1a).потому что пациентов с диагнозом тройной отрицательный рак молочной железы (tnbc) имеют высокий риск рецидива болезни в течение 5 лет, чем больных другими рак молочной железы подвидов [22],мы сравнили ctip mrna уровне в tnbc, не tnbc использование общедоступных - микрочип набор данных (gse47561 [23]).мы обнаружили, что ctip мнений, была значительно ниже в тройной отрицательный рак молочной железы (fig.1b), что согласуется с предыдущего исследования [24].эти результаты свидетельствуют о том, что их уровень ctip снижается в рак молочной железы.кроме того,ctip ген изменения были отмечены в некоторые формы рака, либо с мутацией, исключение или вариаций количества копий (дополнительные рисунок 1c).вместе с тем, случаев изъятия или мутации ctipwas весьма низким в раковых заболеваний.таким образом, мы высказывали предположение, что ctip down-regulation может быть обусловлено эпигенетические или posttranscriptional правилам.